第二代，也就是真正的第三代合成人，是在情人彻底掌控军方之后，为了一些特殊的战斗任务制造出来的超级士兵。这些合成人不但和正常人类几乎完全没有分别，而且经过生物改造，这些克隆人的身体，也能够像正常人类一样，进行二次改造，无论是将他们改造成生化人，还是利用一些方式让他们拥有特定的能力，都可以。唯一的区别就是，这些第三代合成人，会完全遵守情人和科学家，以及一些获得权限的人的命令，它们平时拥有自我意识，但这些意识永远服务于基因中的命令，只需要掌握一些特定的单词组成的密码，这样哪怕这些合成人发生了叛乱，只要说出这些密码，那么得到命令的合成人就会立刻停下所有动作，进入一种植物人的状态，所以有了这个保险，自认也就不会出现真正叛变的情况。

和生化改造人不同，生化改造人可以理解为，向正常人类身上大幅度增加机械改造，也就是格洛丽亚接受的那种，他们虽然只有极小部分还是原本的人类身体，但本质上还是人类，他们拥有真正的自我意识，自然也就会出现叛变的可能，但合成人完全不会。

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第三代合成人利用大多数方法，都无法分辨得出来，唯一的办法，就是通过解剖手术，寻找到它们体内的一些，特殊的多余组织，可能是人造器官，也可能是其他的身体结构。而且第三代合成人实际上有个很大的弊端，就是由于生产线的关系，第三代合成人的控制命令，是完全一致的，只要掌握那些单词密码，理论上就能完全控制所有的第三代合成人，这也是情人和科学家会开始研发第四代，也就是现在最先进的第四代合成人的原因。

第四代合成人，阿登纳，也就是韩祖，之前在无限公司曾经见过几个，这些合成人要比第三代合成人更加优秀，哪怕是完整的解剖手术，也无法分辨出任何区别，而且第四代合成人的单词密钥，全部都是独立的，想要控制第四代合成人，就必须要知道这个单独的单词密钥，而全部的单词密钥，被分成了两个部分，一部分掌握在科学家手中，另一部分则掌握在情人手中，虽然当时科学家想要把全部的密钥都告诉情人，但对方认为，如果两人发生危险，那么这样的做法并不稳妥，所以最终采取了一人记录一半的方式。

以往的三代合成人，常常是与生化改造人对标的东西，在第四代合成人没有出现之前，双方一直各有千秋，生化改造人更加适合战斗，对于损伤的抵抗能力大，不容易被破坏，战斗方面的能力也更加优秀，只需要向机械人一样替换改造的部分，就能够直接获得战斗能力的提升，不需要再去接受训练或者学习。不过由于生化改造技术的原因，如果没有服装的掩护，经过了生化改造的人们，一眼就能被人看出来。

第三代合成人比起正面战斗，更适合融入人群，完成秘密作战，他们的身体与正常人类无异，很难被发现，而且可以通过所有基于人类设计的检测，从正常的医学检测，到什么生物识别技术，都没问题，也不会被什么特殊的干扰设备影响，不会像生物改造人一样，有身体部件被黑客侵入的风险，自然也不会像部分生化改造人一样，出现能源核心被损坏，导致产生巨大爆炸的情况。但毕竟他们是基于克隆技术的产物，所以他们的身体机能，是不如生化改造人的。

总的来说，生化改造人一般被用在正面战场，或者需要面对高危情况的激进行动当中，他们威力巨大，但并不稳定，毕竟他们严格意义上来说，只是经过改造的正常人类，不可能拥有绝对的忠诚。而第三代合成人虽然在战斗方面不占优势，但胜在绝对忠诚，而且能够融入人群，最主要的是，性价比很高。

平均一套完整的生化改造手术所需要的资金，就能够制造五个第三代合成人。所以这也是两种计划能够分庭抗礼的原因，有人